El Sistema Nacional de Áreas Protegidas persigue el objetivo de preservar la diversidad biológica del país y promover el manejo sustentable de las tierras silvestres, promocionando las ventajas potenciales del ecoturismo y el mantenimiento

Así encontramos en la Costa Ecuatoriana 12 Áreas Naturales Protegidas que son:


1.- Reserva Ecológica Manglares Cayapas-Mataje
2.- Refugio de vida Silvestre " La Chiquita"
3.- Reserva Ecológica Cotacachi Cayapas
4.- Reserva Ecológica Mache-Chindul
5.- Refugio de vida Silvestre Manglares Estuario del río
Muisne.
6.- Refugio de Vida Silvestre Isla Corazón y Fragatas
7.- Parque Nacional Machalilla
8.- Área Nacional de Recreación Parque Lago
9.- Reserva de producción de Fauna Manglares el Salado
10.- Reserva Ecológica Manglares Churute
11.- Refugio de vida Silvestre Isla Santa Clara
12.- Reserva Ecológica Arenillas.